Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHD7Q9P2D1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHD7Q9P2D1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms