Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL20A1Q9P218 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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