Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRD1Q9P1U0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms