Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0Z9

PIPOX, Peroxisomal sarcosine oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOXQ9P0Z9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PIPOXQ9P0Z9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms