Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCHIP1Q9P0W5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms