Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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SH3BP4Q9P0V3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4Q9P0V3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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SH3BP4Q9P0V3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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SH3BP4Q9P0V3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4Q9P0V3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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