Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9orf78Q9NZ63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C9orf78Q9NZ63 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms