Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA3Q9NZ52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GGA3Q9NZ52 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms