Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH5Q9NX47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH5Q9NX47 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms