Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT4Q9NX09 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms