Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASF1BQ9NVP2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms