Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LMBRD1Q9NUN5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBRD1Q9NUN5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms