Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TCP11L1Q9NUJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TCP11L1Q9NUJ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP11L1Q9NUJ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms