Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF275Q9NSD4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF275Q9NSD4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms