Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP2Q9NS61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms