Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOPORSQ9NS56 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms