Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRAC1Q9NRG0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRAC1Q9NRG0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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