Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC177Q9NQR7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC177Q9NQR7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms