Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ASCL3Q9NQ33 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASCL3Q9NQ33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms