Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIX2Q9NPC8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIX2Q9NPC8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms