Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPCPD1Q9NPB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPCPD1Q9NPB8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPCPD1Q9NPB8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms