Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAJC4Q9NNZ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAJC4Q9NNZ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms