Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM8AQ9HCN3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM8AQ9HCN3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM8AQ9HCN3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms