Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP29Q9HBJ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP29Q9HBJ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms