Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVMER34-1Q9H9K5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVMER34-1Q9H9K5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms