Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
REEP1Q9H902 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP1Q9H902 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms