Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP3Q9H6T3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP3Q9H6T3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms