Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHX3Q9H6B9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHX3Q9H6B9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms