Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EHD4Q9H223 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD4Q9H223 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD4Q9H223 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms