Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH6AQ9H0K4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms