Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REXO4Q9GZR2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
REXO4Q9GZR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms