Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CFAP74Q9C0B2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CFAP74Q9C0B2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CFAP74Q9C0B2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms