Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ROPN1BQ9BZX4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms