Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC13A1Q9BZW2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A1Q9BZW2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms