Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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