Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
HIRIP3Q9BW71 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HIRIP3Q9BW71 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HIRIP3Q9BW71 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms