Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KATNB1Q9BVA0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KATNB1Q9BVA0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms