Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFHD1Q9BUP0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EFHD1Q9BUP0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms