Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB6Q9BUF5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB6Q9BUF5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB6Q9BUF5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB6Q9BUF5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB6Q9BUF5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB6Q9BUF5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB6Q9BUF5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms