Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT11Q9BT88 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms