Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FYCO1Q9BQS8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
FYCO1Q9BQS8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms