Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SGIP1Q9BQI5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGIP1Q9BQI5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms