Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYT3Q9BQG1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms