Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM4BQ9BQ04 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RBM4BQ9BQ04 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms