Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA3Q99618 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDCA3Q99618 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms