Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SORT1Q99523 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SORT1Q99523 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms