Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBGCP5Q96RT8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms