Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERGIC2Q96RQ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERGIC2Q96RQ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms