Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHIPQ96QV1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HHIPQ96QV1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms