Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPR78Q96P69 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR78Q96P69 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms